Deep learning representations to support COVID-19 diagnosis on CT slices / Representaciones basadas en aprendizaje profundo como apoyo del diagnóstico de la COVID-19 en cortes de tomografía computarizada

Introduction: The coronavirus disease 2019 (COVID-19) has become a significant public health problem worldwide. In this context, CT-scan automatic analysis has emerged as a COVID-19 complementary diagnosis tool allowing for radiological finding characterization, patient categorization, and disease follow-up. However, this analysis depends on the radiologist's expertise, which may result in subjective evaluations. Objective: To explore deep learning representations, trained from thoracic CT-slices, to automatically distinguish COVID-19 disease from control samples. Materials and methods: Two datasets were used: SARS-CoV-2 CT Scan (Set-1) and FOSCAL clinic's dataset (Set-2). The deep representations took advantage of supervised learning models previously trained on the natural image domain, which were adjusted following a transfer learning scheme. The deep classification was carried out: (a) via an end-to-end deep learning approach and (b) via random forest and support vector machine classifiers by feeding the deep representation embedding vectors into these classifiers. Results: The end-to-end classification achieved an average accuracy of 92.33% (89.70% precision) for Set-1 and 96.99% (96.62% precision) for Set-2. The deep feature embedding with a support vector machine achieved an average accuracy of 91.40% (95.77% precision) and 96.00% (94.74% precision) for Set-1 and Set-2, respectively. Conclusion: Deep representations have achieved outstanding performance in the identification of COVID-19 cases on CT scans demonstrating good characterization of the COVID-19 radiological patterns. These representations could potentially support the COVID-19 diagnosis in clinical settings.

Introducción. La enfermedad por coronavirus (COVID-19) es actualmente el principal problema de salud pública en el mundo. En este contexto, el análisis automático de tomografías computarizadas (TC) surge como una herramienta diagnóstica complementaria que permite caracterizar hallazgos radiológicos, y categorizar y hacer el seguimiento de pacientes con COVID-19. Sin embargo, este análisis depende de la experiencia de los radiólogos, por lo que las valoraciones pueden ser subjetivas. Objetivo. Explorar representaciones de aprendizaje profundo entrenadas con cortes de TC torácica para diferenciar automáticamente entre los casos de COVID-19 y personas no infectadas. Materiales y métodos. Se usaron dos conjuntos de datos de TC: de SARS-CoV-2 CT (conjunto 1) y de la clínica FOSCAL (conjunto 2). Los modelos de aprendizaje supervisados y previamente entrenados en imágenes naturales, se ajustaron usando aprendizaje por transferencia. La clasificación se llevó a cabo mediante aprendizaje de extremo a extremo y clasificadores tales como los árboles de decisiones y las máquinas de soporte vectorial, alimentados por la representación profunda previamente aprendida. Resultados. El enfoque de extremo a extremo alcanzó una exactitud promedio de 92,33 % (89,70 % de precisión) para el conjunto 1 y de 96,99 % (96,62 % de precisión) para el conjunto-2. La máquina de soporte vectorial alcanzó una exactitud promedio de 91,40 % (precisión del 95,77 %) para el conjunto-1 y del 96,00 % (precisión del 94,74 %) para el conjunto 2. Conclusión. Las representaciones profundas lograron resultados sobresalientes al caracterizar patrones radiológicos usados en la detección de casos de COVID-19 a partir de estudios de TC y demostraron ser una potencial herramienta de apoyo del diagnóstico.

Diferencias biomecánicas del remate de voleibol en jugadoras prejuveniles y juveniles / Biomechanical differences in volleyball spike by female junior and youth players

Introducción: La técnica del remate es un fundamento técnico-táctico ofensivo primordial en el voleibol, ayudando al equipo a conseguir puntos, y por ende imprescindible para la victoria. Potenciar el hábito motriz implica optimizar la preparación deportiva en todos los niveles. Objetivo: Analizar biomecánicamente las fases del remate de voleibol y variables mecánicas relacionadas en jugadores prejuveniles y juveniles de la Concentración Deportiva de Pichincha. Métodos: Bajo un muestreo intencional no probabilístico, se estudió a 19 voleibolistas del sexo femenino (11 prejuveniles y 8 juveniles) probando biomecánicamente 5 fases del movimiento técnico del remate. Se ensayó el Tiempo Total del Remate, el Tiempo de la Preparación hasta el Golpe y el Ángulo del Cuerpo en Relación al Centro de Gravedad. Resultados: En las 5 fases de la técnica del remate solo existió una diferencia significativa entre los grupos independientes estudiados (Fase 4: p= 0,001) perteneciente al ángulo del codo en la fase de golpeo al balón (menor rango promedio el grupo juvenil: 5,38), el resto no indicó diferencias significativas, aunque los rangos promedios fueron menores en el grupo prejuvenil en la fase 1, 2, 3, y mayores en el mismo grupo para el caso de la 5ta fase (ángulo de la columna: 11,91). Por otra parte, solo se evidenció diferencias significativas en TTR (p= 0,033), y no significativas en el Tiempo de la Preparación hasta el Golpe (TPG: p= 0,717) y el ángulo del cuerpo en relación al centro de gravedad (ACCG: p= 0,717). Conclusiones: Los ángulos de la columna no influyen significativamente en la técnica del remate; no obstante, en los ángulos del codo se observó influencia para una mejor flexión de codo y colocación de la mano, pudiendo generar un mayor impacto al balón y por ende mayores dificultades a la defensa oponente(AU)

Introduction: Spike technique is a fundamental technical-tactical offensive movement in volleyball. It helps the team score points and is therefore essential to win. Strengthening motor skills implies optimizing sport preparation on all levels. Objective: Biomechanically analyze volleyball spike phases and mechanical variables as performed by junior and youth players from Pichincha sports complex. Methods: Nineteen female volleyball players (11 junior and 8 youth) were selected by intentional non-probabilistic sampling to conduct a biomechanical study of the five phases of the technical movement of spike, alongside Total Spike Time (TST), Preparation Time Before the Blow (PTBB), and Body Angle in Relation to the Center of Mass (BARCM). Results: Only one significant difference was found in the five phases of the spike technique in the two independent groups studied (Phase 4: p= 0.001), which had to do with the elbow angle in the ball hitting phase (a smaller average range in the youth group: 5.38). No other significant differences were found, though average ranges were smaller in the junior group in phases 1, 2, 3, and greater in the fifth phase (spine angle: 11.91). Additionally, significant differences were only found in TST (p= 0.033), and non-significant differences in the Preparation Time Before the Blow (PTBB: p= 0.717) and the Body Angle in Relation to the Center of Mass (BARCM: p= 0.717). Conclusions: Spine angles do not exert a significant influence on spike technique. However, elbow angles played a role in better elbow flexion and hand positioning, potentially generating a stronger impact on the ball and therefore greater difficulties for the opponent's defense(AU)

Prescripción de medicamentos en pacientes atendidos en instituciones de mediano y alto nivel de complejidad / Drug prescription patterns in patients attended at a middle- and high-complexity level institution

Objetivo Determinar los patrones de prescripción de medicamentos ambulatorios autorizados en pacientes afiliados a una EPS y atendidos por IPS de mediano y alto nivel de complejidad. Métodos Se realizo un estudio analítico transversal donde se evaluaron las prescripciones de medicamentos en 331 IPS de segundo y tercer nivel de complejidad en 27 departamentos durante el 2006. Resultados Se analizaron 38 863 prescripciones de medicamentos de 3 663 pacientes. El 61,4 por ciento de estas provienen de IPS de tercer nivel de complejidad y principalmente de pacientes afiliados al régimen contributivo. El promedio de medicamentos por formula medica fue de 2,2 (IC 95 por ciento: 2,1 a 2,2 por ciento), la proporción de antibióticos por fórmula médica del 29,2 por ciento (IC 95 por ciento: 28,7-29,6), de medicamentos POS del 64,2 por ciento (IC 95 por ciento 63,7-64,6 por ciento) y de inyectables del 22,1 por ciento (IC 95 por ciento 21,7-25,5 por ciento). Más de la mitad de los medicamentos, 62,1 por ciento (IC 95 por ciento 61,5-62,7 por ciento), corresponden a agentes anti-infecciosos, antineoplasicos y del tracto alimentario .El consumo de medicamentos fue de 8,39 Dosis Diarias Definidas (DDD) /1 000 usuarios/día y el costo por DDD fue de $ 5 216 Conclusión Este análisis permitió identificar medicamentos cuya frecuencia de formulación no se correlaciono con el perfil epidemiológico como agentes inmunomoduladores y hormona de crecimiento. Existen diferencias en la frecuencia y cantidad de DDD de medicamentos autorizados por régimen de afiliación lo cual pude ser evidencia de barreras de acceso a los medicamentos en la población.

Objective Determining prescription patterns for outpatient medication authorised for patients affiliated to an EPS and assisted by medium- and high-level complexity IPS. Methods This was a cross-sectional study where medication prescription was evaluated in 331 second- and third-level complexity hospitals from 27 Colombian departments during 2006. Results 38 863 prescriptions for 3 663 patients’ medication were analysed. 61,4 percent came from third-level complexity hospitals, mainly for patients affiliated to contribution-based regimes. Average prescribed medication per person was 2,2 (2,1-2,2 95 percent CI), the percentage of antibiotics formulated by prescription was 29,2 percent (28,7-29,6 95 percent CI), essential prescribed medicines accounted for 64,2 percent (63,7-64,6 95 percent CI) and injectable medicines was 22,1 percent (21,7-25,5 percent). More than half the medications (62,1 percent; 61,5-62,7 95 percent CI) were in ATC groups such as anti-infectious agents, immunomodulating agents and medications for the alimentary and metabolic tract. DU90 percent consisted of 64 medications, medication consumption being 8,39 daily de-fined doses (DDD)/1 000 patients, costing 5 216 Colombian pesos per DDD. Conclusions This analysis led to identifying medications whose formulation frequency did not correlate with an epidemiologic profile as immunomudulator and growth-hormone (somatotropin) agents. There were differences in the frequency and quantity of DDD medications authorised by type of affiliation which could thus be providing evidence of obstacles to the population having access to drugs/medicaments.

Using systematic reviews for evidence-based health promotion: basic methodology issues

Systematic reviews and evidence-based recommendations are becoming increasingly important for decision-making in health and medicine. Systematic reviews of population-health interventions are challenging and methods will continue evolving. This paper provides an overview of how evidence-based approaches in public health and health promotion are being reviewed to provide a basis for Colombian Guide to Health Promotion, analysing limitations and recommendations for future reviews.

La importancia de las revisiones sistemáticas y de las recomendaciones basadas en la evidencia está aumentando cada vez más, para la toma de decisiones en salud y medicina. Las revisiones sistemáticas de intervenciones poblacionales están aun en crecimiento y sus métodos en continuo desarrollo. Este artículo provee una mirada de cómo una aproximación de salud publica y promoción de la salud basada en la evidencia es útil para la formulación de guías nacionales en promoción de la salud; analizando sus limitaciones y recomendaciones para futuras revisiones.